Tallinnan historiallinen synagogarakennus, joka vihittiin käyttöön vuonna 1885, tuhoutui toisessa maailmansodassa. Uuden rakennuksen rakennustyöt alkoivat 2005 ja synagoga avattiin vuonna 2007.
Nykyinen synagoga on yksi Tallinnan epätavallisimmista pyhäköistä, jossa kiitosta saanut moderni design on yhdistetty perinteiseen synagoga-arkkitehtuuriin. Rakennus kuuluu kokonaisuuteen, johon kuuluvat synagogan lisäksi myös Tallinnan juutalaisen koulun rakennus, juutalainen yhteisökeskus ja museo.
Toisessa kerroksessa sijaitsee jumalanpalveluun käytettävä sali, jonne mahtuu 105 henkeä. Rukoushuoneen lattialla on 105 istumapaikkaa miehille ja parvella 65 naisille.
Opaspalvelut ryhmille ovat ennakkosopimuksella ja maksullisia.