13. gadsimtā celtajā Nigulistes baznīcā esošais muzejs ir viens no retajiem muzejiem, kas atrodas sakrālā celtnē. Izbaudi baznīcas mākslu tās vēsturiskajā kontekstā: šeit atrodas viduslaiku kapakmeņi, unikāli altāri un Tallinas slavenākais mākslas darbs – fragments no Bernta Notkes gleznas "Nāves deja". Šī vairāk nekā piecsimt gadu senā glezna parāda viduslaiku cilvēka pasaules redzējumu, taču ir aktuāla arī šodien. Īpaši vērtīgas ir Sudraba kambarī eksponētās baznīcu, kā arī ģilžu-cunfšu un Melngalvju brālības sudrablietas.

Uz baznīcas torni ved stikla lifts un "debesu stāvs", no kura paveras 360° skats uz vecpilsētu.